Tutkijatohtori superresoluutio-mikroskopiaan bakteerisoluissa

Aalto-yliopisto on rohkeiden ajattelijoiden yhteisö, jossa tiede ja taide kohtaavat tekniikan ja talouden. Tunnistamme ja ratkaisemme yhteiskunnan suuria haasteita ja rakennamme innovatiivista tulevaisuutta. Yliopistossa on kuusi korkeakoulua, lähes 11 000 opiskelijaa ja henkilöstöä noin 4000, joista lähes 400 on professoreita. Pääkampuksemme sijaitsee Espoon Otaniemessä.

Yksittäisten molekyylien dynamiikka soluissa -tutkimusryhmä Aalto-yliopiston perustieteiden korkeakoulun Neurotieteen ja lääketieteellisen tekniikan laitos hakee

Tutkijatohtoria superresoluutio-mikroskopiaan bakteerisoluissa.

Hanke tutkii solujen biofysikaalisia sopeutumismekanismeja ympäristön stressitekijöihin sekä kehittää uusia menetelmiä yksittäisten molekyylien dynamiikan kvantifiointiin ja ymmärtämiseen.

Monet mikro-organismit kestävät ankaria ympäristöolosuhteita, kuten äärilämpötiloja, säilyttäen kuitenkin solunsisäisen tasapainon ja organisaation. Tutkimusta varten käytämme huipputason superresoluutio-mikroskopiaa ja yksittäisten molekyylien seurantamenetelmiä mitataksemme molekyylien liikkettä elävissä soluissa. Molekyylien dynamiikka kertoo niiden välisistä vuorovaikutuksista reaaliajassa ja toimii anturina solun sisäisen ympäristön muutoksille.

Tämä auttaa meitä ymmärtämään mikro-organismien sopeutumista erilaisiin ympäristöihin ja solupohjaisen elämän rajat. Tutkimus edistää myös synteettisen biologian sovellusten ja uusien analyysiratkaisujen kehitystä.

Tehtävän rooli ja tavoitteet

Etsimme innostunutta ja motivoitunutta tutkijatohtoria, joka haluaa hyödyntää superresoluutio-mikroskopiaa ja yksittäisten molekyylien seurantamenetelmiä tutkiakseen lämpötila-adaptoitumista termofiilisissa, mesofiilisissa ja psykrofiilisissa bakteereissa. Mikroskopian lisäksi projektissa hyödynnetään geneettistä muokkausta, biokemiallisia menetelmiä, RNA-sekvensointia, koneoppimista ja mallinnusta yksittäisen molekyylidatan tukemiseen.

Sovellat olemassa olevia ja kehität uusia menetelmiä sekä protokollia biologisiin mittauksiin ja datan analysointiin. Tuloksia käytetään hypoteesien testaamiseen ja todentamiseen. Toteutat myös yhteistyöprojekteja ryhmän jäsenten ja muiden yliopistojen tutkijoiden kanssa. Olet oma-aloitteinen ja itseohjautuva tutkija, joka organisoi projektinsa tehokkaasti ja esittelee tulokset ryhmänsisäisissä ja ulkoisissa kokouksissa ja seminaareissa.

Tiimisi

Tukimustyön ohjaajana toimii Assistant professori Jarno Mäkelä, joka johtaa Yksittäisten molekyylien dynamiikka soluissa -tutkimusryhmää. Monitieteinen tiimimme koostuu mikrobiologian, mikroskopian, biofysiikan, insinööritieteiden ja koneoppimisen osaajista. Tiimi mahdollistaa yhteistyöhön perustuvan ympäristön, jossa tutkijat saavat jaettua tietoa ja kokemusta mikroskopiasta, kokeellisesta laboratoriotyöstä, datan analysoinnista ja mallintamisesta.

Työskentelemme useiden aiheiden parissa fysiikan, kemian ja biologian rajapinnassa: solunsisäinen organisaatio, makromolekyylien pakkautuminen, neste-neste-faasierottelu, proteiinien dynamiikka jne. Tutkimusryhmän tarkoituksena tukea ja inspiroida sen jäseniä, antaa akateemista koulutusta ja kehittää keskeisiä taitoja tulevaisuutta varten.

Mitä odotamme sinulta?

• Tohtoritutkinto joltakin seuraavista aloista tai niihin läheisesti liittyvältä alalta: mikrobiologia, biofysiikka, biokemia tai bioteknologia
• Vankka kokemus bakteerian kasvatuksesta ja niiden molekyylibiologiasta
• Kokemusta genomin muokkausmenetelmistä bakteereissa (kloonaus, kromosomin muokkaus)
• Aikaisempaa kokemusta fluoresenssimikroskopiasta
• Ohjelmointitaitoja (Python/R/Matlab tai vastaava) datan käsittelyyn ja analysointiin
• Kyky ja kiinnostus työskennellä tuloshakuisesti monitieteisessä tiimissä
• Hyvä motivaatio ja periksiantamattomuus haastavien tieteellisten ongelmien ratkaisemiseksi
• Edellytämme erittäin hyvää englanninkielen suullista ja kirjallista taitoa. Suomenkielen taitoa ei vaadita.
  

Mitä tarjoamme sinulle

Tarjoamme sinulle mielenkiintoisen työn inspiroivassa työympäristössä. Pääset työskentelemään yhteisössä, joka panostaa jatkuvaan kehittymiseen, yhteistyöhön ja avoimeen viestintään. Perehdytämme sinut tehtäviisi, ja pääset mukaan ystävälliseen ja osaavaan tiimiin, joka auttaa sinua eri haasteissa.

Työn aloituskuukausi on elokuu 2025 (tai erikseen sovittu ajankohta) ja työsopimus tehdään 2-vuodeksi, jonka kestoa on mahdollista jatkaa sovitusti. Tehtävän palkkaus määräytyy Aalto-yliopistossa käytössä olevan yliopistojen palkkausjärjestelmän mukaisesti. Tutkijatohtorin palkka on n 4200-4360 €/kk kokemuksesta riippuen. Aalto-yliopiston tutkimushenkilöstö noudattaa kokonaistyöaikaa, joka on 1612 tuntia vuodessa.

Työpisteesi sijaitsee uudistuneella ja elävällä Otaniemen kampusalueella, jossa on monipuoliset palvelut ja hyvät kulkuyhteydet metron, uuden pikaraitiotien ja isojen väylien varrella.

Työntekijöiden käytettävissä ovat hyvät työterveyspalvelut. Aalto-yliopisto tarjoaa monipuolisen koulutus- ja kurssitarjonnan henkilöstölleen ja kannustaa henkilöstöään osallistumaan niihin. Aalto-yliopiston jäsenenä saat myös liikuntapalveluita henkilöstöhinnalla Unisportilta ja lounastat lukuisissa kampusravintoloissa henkilöstöhinnalla. Lisäksi tarjoamme matkalippuedun.

Tukimukseen liittyvät projekti(t):

ERC TEMPADAPT projekti (https://cordis.europa.eu/project/id/101075984)

Kiinnostuitko?

Jos innostuit tehtävästä ja haluat liittyä joukkoomme, lähetä seuraavat asiakirjat (PDF, englanniksi) rekrytointijärjestelmämme kautta ("Apply now") viimeistään 27.4.2025 (23:59 suomen aikaa).

• Motivaatiokirje (kuvaa selkeästi kiinnostuksen kohteesi, miten voit edistää projektia ja miten täytät yllä mainitut vaatimukset)
• CV (max 2 sivua)
• Julkaisuluettelo
• Kopio tutkintotodistuksesta
• Vähintään kahden suosittelijan yhteystiedot

Huomaa:
Aalto-yliopiston työntekijöiden tulee hakea tehtävää sisäisen HR-järjestelmämme Workdayn (sisäiset työpaikat) kautta käyttämällä olemassa olevaa Workday-käyttäjätiliään (ei avointen työpaikkojen ulkoisen verkkosivun kautta).
Aalto-yliopiston opiskelijoiden ja vierailijoiden tulee hakea ulkopuolisina hakijoina henkilökohtaisella sähköpostiosoitteella (ei Aalto-sähköpostilla)

Lisätietoja tehtävästä antaa Assistant Prof. Jarno Mäkelä (jarno.p.makela(at)aalto.fi)

Aalto-yliopisto pidättää oikeuden perustelluista syistä jättää tehtävän avoimeksi, pidentää hakuaikaa, avata hakuprosessin uudelleen ja ottaa huomioon hakijat, jotka eivät ole jättäneet hakemusta hakuajan kuluessa.

Käymme hakemukset läpi ja saatamme kutsua sopivia hakijoita haastatteluun jo hakuaikana. Tavoitteenamme on läpinäkyvä ja tasapuolinen rekrytointiprosessi, joten kysy rohkeasti palautetta.